(1)培養箱 

在分子生物學試驗中，有很多反應都是在特定溫度下進行的，這時就需要一個控溫的裝置。例如：用于細菌的平板培養，我們通常設定為37℃于培養箱倒置培養；其他分子生物學實驗如酶切等需要25℃，30℃，37℃等條件。

(2)冰箱 

冰箱是實驗室保存試劑和樣品必不可少的儀器。分子生物學實驗中用到的試劑有些要求是4度保存，有些要求是負20度保存，實驗人員一定要看清試劑的保存條件，放置在恰當的溫度下保存。具體來說，不同溫度下保存的物品如下：

a. 4℃適合儲存某些溶液、試劑、藥品等。

b.-20℃適用于某些試劑、藥品、酶、血清、配好的抗生素和DNA、蛋白質樣品等。

c.-80℃適合某些長期低溫保存的樣品、大腸桿菌菌種、純化的樣品、特殊的低溫處理消化液，感受態等的保存。

d.0-10℃的層析冷柜適合低溫條件下的電泳、層析、透析等實驗。

(3)搖床 

搖床是實驗室常用儀器，一般有常溫型和低溫型兩種。對于分子生物學實驗室，如果能配置低溫型搖床，就可以適應不同的實驗需求。例如：用于大腸桿菌，酵母菌等生物工程菌種的振蕩培養及蛋白的誘導表達，培養通常為28度和37度，誘導表達需要20-37度；在感受態的制備過程中，需要有18度的溫度控制；用于蛋白凝膠的染色脫色時振蕩，常溫使用；用于大腸桿菌常規轉化時振蕩復蘇，常為37度。對于控制溫度低于室溫時，我們需要低溫型搖床來控溫。

(4)水浴鍋 

水浴鍋也是一種控溫裝置，水浴控溫對于樣品來說比較快速且接觸充分。例如，用于42度的大腸桿菌轉化時的熱激反應；用于DNA雜交過程中水浴控溫。

(5)烘箱 

烘箱是用于滅菌和洗滌后的物品烘干。烘箱有不同的控溫范圍，用戶可以根據實驗需求進行選擇。例如，有些塑料用具只能在42-45℃的烤箱中進行烘干；用于RNA方面的實驗用具，需要在250℃烤箱中烘干。

(6)純水裝置 

純水裝置包括蒸餾水器和純水機。蒸餾水器的價格便宜，但在造水過程中需要有人值守；純水機價格高些，但是使用方便，可以儲存一定量的純水。純水使用也有不同的級別，一般實驗用水需要純水，用于PCR、DNA測序、酶反應均需要超純水。

(7)滅菌鍋 

分子生物學所用到的大部分實驗用具都應嚴格消毒滅菌。包括實驗物品、試劑、培養基等。滅菌鍋也有不同大小型號，有些是手動的，有些是全自動的。用戶需要根據自己的需要選購。

(8)天平 

天平用于精確稱量各類試劑。實驗室常用的是電子天平，電子天平按照精度不同有不同的級別。

(9)液體量器 

液體量器用于精密量取各類液體。常見的液體量器有量筒、移液管、微量取液器、刻度試管、燒杯。

(10)pH計

 用于配置試劑時精確測量PH值，從而保證配置的溶液的精確性。有時也需要利用pH計測定樣品溶液的酸堿度。

(11)分光光度計 

分光光度計通過測定吸光值，從而用于分析樣品核酸和蛋白的含量及純度；同時也可以測定培養菌液的濃度。

(12)離心機 

離心機有冷凍和常溫之分。主要用于收集微生物菌體、細胞碎片以及其他沉淀物。有些樣品由于在常溫下不太穩定，需要低溫環境。例如在感受態制備過程中必須保證低溫環境，所以需要冷凍離心機。

(13)超凈工作臺 

分子生物學中凡是涉及對細菌的操作均需在超凈工作臺下完成，還有感受態制備，轉化反應等，都需要無菌的環境。

(14)電泳系統 

實驗室常用的電泳主要是三種：水平電泳用于核酸DNA/RNA的瓊脂糖電泳檢測；垂直電泳用于蛋白的聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測；轉印電泳用于將蛋白轉印到膜上做western檢測。

(15)PCR儀 

PCR儀有不同的類型，分別用于不同的實驗。普通和梯度PCR儀用于基因克隆和基因檢測過程中DNA/RNA的擴增。熒光定量PCR儀用于核酸定量分析、基因表達差異分析、單核苷酸多態性檢測、甲基化檢測。原位PCR儀用于鑒定和定位帶有靶序列的細胞在組織中的位置。

(16)凝膠成像分析系統/紫外檢測儀 

凝膠成像系統用于對染色后的核酸瓊脂糖電泳膠和蛋白聚丙烯酰胺凝膠的觀察和拍照，有些可以進行切膠操作。紫外檢測儀可以用于對染色后的核酸瓊脂糖電泳膠的觀察，膠回收時切膠操作，但是不能連接電腦拍照。

(17)制冰機 

實驗室常用的是雪花制冰機，制冰機一般是按每日制冰量分成不同型號。分子實驗室中制造大多數核酸、蛋白質的實驗操作所需的低溫環境，以減少核酸酶或蛋白質酶的水解。感受態制備也需要長時間冰浴。

(18)磁力攪拌器 

在配置試劑過程中，有些試劑較難溶解，這時需要借助磁力攪拌器。磁力攪拌器可以加速溶解固體內容物。磁力攪拌器一般帶加熱功能。

(19)生物安全柜 

分子實驗中涉及的試劑和樣品很多是有毒的，對于操作人員來說傷害較大。為了防止有害懸浮微粒、氣溶膠的擴散，可以利用生物安全柜對操作人員、樣品及樣品間交叉感染和環境提供安全保護。

(20)微波爐和電爐 

用于溶液的快速加熱，電泳瓊脂糖凝膠的加熱溶化配制，固體培養基的加熱溶化。

(21)液氮罐 

分子生物學實驗中感受態細胞的制備需要液氮處理。感受態的保存也可以存于液氮中。

(22)微管移液器 

微管移液器也有不同型號，是用于準確量取特定體積的溶液。